棘阿米巴角膜炎的诊断建立在从角膜病灶中取材涂片染色找到棘阿米巴原虫或从角膜刮片培养出棘阿米巴的基础上。常用的染色方法有Giemsa染色、PAS染色和Gram染色，前两种染色可以显示典型的包囊，有条件者，行荧光钙白染色(荧光显微镜检查)。棘阿米巴培养需使用大肠杆菌覆盖的非营养性琼脂培养基。必要时可作角膜活检。角膜共焦显微镜有助于棘阿米巴角膜炎的活体诊断。

　　疾病早期，可试行病灶区角膜上皮刮除。药物治疗选用二咪或联咪类药(0.15%羟乙醛酸双溴丙咪)，咪唑类(咪康唑10mg/ml)或强化新霉素。最近有应用0.02%洗必泰和0.01%～0.02%PHMB(polyhexamethylene biguanide，聚六甲撑双胍)成功治疗棘阿米巴角膜炎报道。

　　棘阿米巴药物治疗一般疗程较长，治疗初期局部用药可1次/小时，待症状明显改善后逐渐减少为每天4～6次，疗程4月以上，直至感染完全控制，虫体全部被杀死，若维持治疗期间中断用药，则容易反复使病情恶化。糖皮质激素药物的应用有恶化病情的危险，一般不主张使用。

　　病灶局限，药物治疗失败或形成严重影响视力的角膜基质混浊(感染已完全控制，炎症也已消退)，可行穿透性角膜移植(手术视频)。术后应继续药物治疗，减少术后复发。棘阿米巴感染蔓及巩膜时，药物或手术治疗效果不佳，愈后不良。

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