先天性麻痹性斜视应根据具体的眼肌检查结果决定治疗方法，看看眼球运动的不平衡在哪个眼位方向上最严重，就是这个方向上配偶肌有问题，如果定量三棱镜检查达到了手术量，可以以减弱麻痹肌的拮抗肌(亢进肌肉)为原则进行手术;如果不能手术，也可以佩戴三棱镜。

　　当然，有些情况是很复杂的，因为原发的麻痹肌可以引起其拮抗肌，配偶肌，配偶肌的拮抗肌等继发改变，每个病人的具体情况也是不同，所以最好是有具体的病例讨论，否则只是纸上谈兵，没有太多意义。

　　但有一点，儿童的先天麻痹性斜视常常伴有代偿头位，这是人类进化的结果，以牺牲头位换取双眼单视的功能，这是好事，有些家长不太明白，一味的纠正孩子的头位，以为是对孩子好，殊不知纠正好了头位就意味着孩子双眼视的丧失，所以一旦儿童先天性麻痹斜视患者的头位不明显者，就意味着即使手术，双眼视的功能也可能不易恢复，可以作为术后功能恢复的一种大概估计。

　　我们通常鉴别孩子是不是由于眼科斜视引起的歪头，在临床上有一个最简单的方法就是把孩子的一只眼睛用纱布遮住，遮盖后如果孩子的歪头症状减轻或者消失，这时应该高度警惕先天性斜视造成的代偿头位。