牡丹江医学院第二附属医院的前身是牡丹江铁路中心医院，始建于1946年9月15日，是只有8个职工的卫生所。全国解放后即1949年职工人数增加到70人，发展至2004年，已成为一所集医疗、保健、急诊急救、教学、科研于一体的综合性二级甲等医院。这个时期，医院是计划经济管理体制，属于铁路企业医院，牡丹江铁路分局给医院拨款，医院为牡丹江铁路分局辖区内的职工家属提供医疗保健服务。2004年9月17日，按照黑国资分〔2004〕10号文件《关于同意哈尔滨铁路局教育医疗机构移交省教育厅管理的批复》，牡丹江铁路中心医院正式归属于牡丹江医学院，并更名为现在的医学院第二附属医院。占地面积31405平方米，建筑面积35489.69平方米，拥有价值3942万元的医疗设备，固定资产总值8997万元。省编办核定人员编制571人，床位385张。在全院职工中，中级以上职称的占239人、初级以下职称的占332人。医院在过去的60年里，为哈尔滨铁路局东部地区5万余名职工和8万余名家属的医疗救护、预防保健工作做出了卓越的贡献，特别是更名为医学院第二附属医院这两年多来，在医学院的直接领导和大力扶持下，医院在技术、服务、环境、设备等方面有了很大的改观，现已发展成为集医疗、教学、科研、急诊、急救、康复、保健于一体的综合性医院。医院奉行“以病人为中心、以教学为支撑、以人才为根本、以质量为保证的宗旨，创新经营方式，打造服务品牌，创办平民医院，以现代化的医疗设备，技术精良的学科群体，价格低廉的超值服务，造福于家乡父老。目前，医院在以院长柳耀环为首的新一届领导班子的带领下，确立了“改革、创新、发展”的工作思路，以“打造名牌医院、提升服务品位、加快医院发展”为目标，靠科技兴院，靠人才强院，使医院的科技水平和综合实力持续提升。

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