目前，绝大多数眼药水中含有防腐剂成分，长期使用，不仅可对角膜上皮产生损害，而且对结膜杯状细胞产生严重损伤，而导致干眼症的发生。同时，长期应用抗生素眼药水，有可能造成正常结膜囊内菌群紊乱，致使在正常情况下不发生致病作用的细菌，发生感染，即条件致病菌性感染。

　　更为严重、也是非常值得注意的是，长期应用激素类眼药水，有可能导致“皮质类固醇性青光眼”的发生，这种类型的青光眼往往不易及时发现，至晚期才被确诊为青光眼，而青光眼所造成的视功能损伤是不可逆的，部分患者由于长期应用激素类眼药而导致失明的现象，已经引起眼科医生的忧虑。