重症沙眼常发生以下后遗症和并发症：①沙眼性上睑下垂：沙眼感染早期即可出现，上睑提举无力，呈欲睡状。在早期是沙眼引起的浸润、充血、水肿而使上睑重量增加和米勒氏肌被侵犯所致。

　　晚期则由于米勒氏肌被破坏、瘢痕形成、失去收缩能力而成永久性上脸下垂。②睑内翻倒睫：极为常见，由于结膜瘢痕收缩和睑板弯曲畸形，使睑缘向内翻转，而产生倒睫。③角膜混浊：严重的角膜血管翳及脸内翻倒睫摩擦角膜以致角膜溃疡，角膜混浊，视力损害。

   　 ④睑球粘连：穹隆部因结膜瘢痕收缩而缩短，尤以下穹隆部为显著，甚至穹隆部完全消失。当牵引下睑时在眼睑和眼球间的结膜可见有垂直的皱襞，即为本征。

    　⑤实质性结膜干燥症：由于结膜广泛结瘢，使杯细胞和副泪腺分泌功能遭到破坏，泪腺管闭塞，以致结膜不能被湿润，而逐渐干燥，角结膜上皮发生角化，可使视力严重受损。

　　⑥慢性泪囊炎：沙眼病变累及泪道黏膜，鼻泪管发生狭窄或阻塞，导致慢性泪囊炎。