张春巍 刘平
哈尔滨医科大学附属第一医院眼科医院150001
目的:运用串联质谱法的蛋白质组技术,鉴定和分析成年男性正常晶状体纤维蛋白质,探索晶状体纤维蛋白质组研究方法为研究晶状体相关疾病奠定基础。
方法:基于串联质谱研究健康成人晶体纤维的两种实验方法,一种方法晶状体纤维总蛋白质通过聚丙稀酰胺凝胶电泳初步分离、胶内酶切后的多肽利用反相液相色谱串联质谱的方法,对晶状体中的全部纤维蛋白质进行鉴定;另一种方法晶状体蛋白质混合物被尿素溶解后,做成凝胶块,胶内酶切后的多肽通过二维液相色谱串联质谱的方法,鉴定晶状体中的全部纤维蛋白质。
结果:串联质谱应用AMASS软件进行质量控制筛选,同时应用反向数据库搜索法评价假阳性率结果,具有可信度超过97%以上、具有2个或2个以上不同的合格谱图的蛋白质作为阳性鉴定结果,两种实验方法共鉴定68个蛋白质。其中43个蛋白都被两种方法鉴定,只有1个蛋白被二维液相色谱串联质谱的方法鉴定。
结论:该研究提示聚丙稀酰胺凝胶电泳串联质谱方法比二维液相色谱串联质谱的方法更适合分析晶体纤维蛋白质,实验结果丰富了晶体纤维蛋白质数据,为以后研究晶状体蛋白质随年龄及白内障形成过程中的变化提供了实验方法和数据。
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