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大鼠视网膜缓慢变性/盘膜边缘蛋白基因的克隆

http://www.cnophol.com 2009-7-7 10:00:45 中华眼科在线

  3 讨论

  RDS小鼠视网膜的光感受器细胞外节发育异常,然后光感受器细胞缓慢变性死亡,其病理改变过程与人视网膜色素变性极其相似[5]。Travis采用消减杂交法从6~7周的C57BL/6小鼠minus6~7周的rd/rd小鼠视网膜文库中首次分离了正常小鼠的野生型RDS/peripherin基因的全长度cDNA克隆,并且发现RDS/RDS小鼠存在RDS/peripherin基因缺陷。基因第2外显子(cDNA序列中第899位核苷酸)插入了约10 kb的外源性基因片段,导致编码的蛋白产物C端的87个氨基酸残基被截断[6]。把正常拷贝数的RDS/peripherin基因插入到RDS小鼠后,观察到正常光感受器细胞外节的形成,在形态学上未发现光感受器细胞变性的征象[7]。动物实验结果提示:RDS/peripherin是视网膜变性的候选基因。

  在视网膜色素变性[8]、黄斑营养不良[9]等患者中相继发现了RDS/peripherin基因突变。连锁分析同样提示:RDS/peripherin基因可能是视网膜变性疾病的候选基因。但目前对RDS/peripherin基因的正常功能和突变基因的致病机制知之甚少。为了进一步探讨RDS/peripherin基因在体外、 体内对光感受器细胞的作用,本研究克隆了大鼠RDS/peripherin基因,为研究视网膜变性的致病机制和治疗奠定了物质基础。

  图4 克隆的SD大鼠RDS/peripherin基因的cDNA序列(下划线:阅读框架)及与文献报道的序列(斜体)的比较[1]。

  Fig.4 Sequences of colned RDS/peripherin cDNA of SD rat(underlined:reading frame)as compared with that reported in literature(italics)[1].

  根据小鼠、人、牛、大鼠的cDNA序列,预测相应RDS/peripherin蛋白的氨基酸序列,发现同源性为85%,其中大鼠和小鼠同源性为97.1%[10]。根据这一特点,我们参照从Gene Bank中查询到的大鼠RDS/peripherin全长度的cDNA序列,设计并合成了引物,以SD大鼠的polyA+RNA为模版,采用RT-PCR的方法成功地扩增了大鼠RDS/peripherin cDNA。测序结果与Begy等报道的相应序列[1]相比较,除3′端非翻译区的序列有所不同外,5′端非翻译区和编码区序列完全相同。不同的序列是:①本研究中第1 242位碱基为G,而文献报道为A。②第1 409~1 411位的碱基为CCA,而文献报道为CA,减少了一个碱基C。分析出现不同序列的可能原因是:①PCR扩增过程中出现碱基错配。本研究采用了Expand High fidelity PCR system替代Taq DNA聚合酶,它是Taq DNA聚合酶和Pwo DNA聚合酶一定比例的混合物。因为Pwo DNA聚合酶对错配的碱基具有3′~5′的外切酶活性,所以碱基错配率由Taq DNA聚合酶的2.6×10-5下降为8.5×10-6,最大限度地减少了碱基错配的可能性。②测序过程中出现碱基错配。我们通过多次测序,对重叠部分进行比较,排除了这种可能性。③RDS/peripherin cDNA序列存在多态性。上述不同序列的碱基位于3′端非翻译区,因此并不影响编码蛋白产物的结构。

  大鼠RDS/peripherin基因的成功克隆,为进一步深入研究RDS/peripherin基因的作用奠定了良好基础。RDS/peripherin基因在真核细胞中的表达和作用的研究正在进行之中,我们将另文报道。

  志谢 湖南医科大学肿瘤研究所的曹亚教授,湖南医科大学附二院中心实验室的吴轰教授,华西医科大学遗传室的夏庆杰讲师,眼科分子生物学研究中心的敬慧娥、刘戟、张文老师在课题研究中所给予的无私帮助

  本课题受国家自然科学基金(基金号39670772)和中国博士后科学基金资助

  4 参考文献

  [1] Begy C,Bridges CD.Nucleotide and predicted protein sequence of rat retinal degeneration slow(rds).Nucle Acids Res,1990,18:3058.

  [2] Goldberg AF,Molday RS.Defective subunit assembly underlies a digenic form of retinitis pigmentosa linked to mutations in periphe-rin/rds and rom-1.Proc Natl Acad Sci USA,1996,93:13726-13730.

  [3] Keen TJ,Inglehearn CF.Mutations and polymorphisms in the human peripherin/RDS gene and their involvement in inherited retinal degeneration.Hum Mutat,1996,8:297-303.

  [4] 萨姆布鲁克 J,弗里奇E.F,曼尼阿蒂斯T.分子克隆实验指导.金冬雁,译.第二版.北京:科学出版社,1992.34-57.

  [5] Hawkins RK,Jansen HG,Sanyals S,et al.Development and degeneration of retina in rds mutant mice:photoreceptor abnormalities in the heterozygotes.Exp Eye Res,1985,41:701-720.

  [6] Travis GH,Brennan MB,Danielson PE,et al.Identification of photoreceptor-specific mRNA encoded by the gene responsible for retinal degeneration slow(rds).Nature,1989,338:71-74.

  [7] Travis GH,Groshan KR,Lloyd M,et al.Complete rescue of photoreceptor dysplasia and degeneration in transgenic retinal degeneration solw(rds)mice.Neuron,1992,9:113-119.

  [8]  Kajiwara K,Hahn LB,Mukai S,et al.Mutation in the human retinal degeneration slow gene in autosomal dominant retinitis pigmentosa.Nature,1991,354:480-483.

  [9] Piguet B,Heon E,Munier FL,et al.Full Characterization of the maculopathy associated with an Arg-172-Trp mutation in the RDS/peripherin gene.Ophthalmic Genet,1996,17:175-86.

  [10] Travis GH,Christerson L,Danielson PE,et al.The human retinal degeneration slow(RDS)gene:chromosome assignment and structure of the mRNA.Genomics,1991,10:733-739.

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(来源:互联网)(责编:xhhdm)

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